RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR2J1Q9GZK6 312 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MS4A6AQ9H2W1 248 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 RERGLQ9H628 205 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF442Q9H7R0 627 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ACOT13Q9NPJ3 140 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MMP26Q9NRE1 261 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 HRASLS2Q9NWW9 162 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 NFASCO94856 1347 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 NLRP1Q9C000 1473 aa2.9□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 KDM5DQ9BY66 1539 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 TAF1LQ8IZX4 1826 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM150BA6NC51 233 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 J3KT08 172 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 K7N7A8 449 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MYL12BO14950 172 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 EDF1O60869 148 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CDRT1O95170 752 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CD160O95971 181 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CATP04040 527 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CTSLP07711 333 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR5AC1P0C628 307 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CT45A6P0DMU7 189 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CT45A5P0DMU8 189 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CT45A7P0DMV0 189 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ORM2P19652 201 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP6V0CP27449 155 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 IMPA1P29218 277 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 AQP1P29972 269 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 LHX2P50458 406 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 AKR1C2P52895 323 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR12D2P58182 307 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 FMODQ06828 376 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 GUSBP1Q15486 140 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR8B8Q15620 311 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 IQCJQ1A5X6 159 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC25A52Q3SY17 297 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CT45A1Q5HYN5 189 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 C1orf195Q5TG92 126 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM215Q68D42 235 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 DNMBPQ6XZF7 1577 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM231DQ6ZW35 169 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF567Q8N184 647 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MS4A15Q8N5U1 240 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR4M1Q8NGD0 313 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR52E2Q8NGJ4 325 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR1L8Q8NGR8 309 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 CT45A3Q8NHU0 189 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 PTX4Q96A99 478 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 DNAJC19Q96DA6 116 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 BTN2A3PQ96KV6 586 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 OR4K3Q96R72 315 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 EBPLQ9BY08 206 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 PRO1933Q9H354 126 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 HES4Q9HCC6 221 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SCML2Q9UQR0 700 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 FANCAO15360 1455 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 ABCC10Q5T3U5 1492 aa2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MAP3K1Q13233 1512 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A0G2JLM5 398 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A1B0GWB2 263 aa2.88□□□□□ -1.95
GNPTAB-208ENST00000550718 MEIS3P1A6NDR6 274 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms