RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 LY6G5BQ8NDX9 201 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP37Q8NFH4 326 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF185Q96GF1 192 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 NMNAT3Q96T66 252 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM222Q9H0R3 208 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 LINC00527Q9UJ94 153 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 POMPQ9Y244 141 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PXMP4Q9Y6I8 212 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPRKQ15262 1439 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TNS3Q68CZ2 1445 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SSH2Q76I76 1423 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF1BO60333 1816 aa2.75□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A087WUU8 490 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0J9YY10 115 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1B0GX78 115 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 C9JAW5 83 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 C16orf97H3BN30 126 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 K7EQG2 157 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 CORTO00230 105 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC37A4O43826 429 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 GNG7O60262 68 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR7C2O60412 319 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 CSN2P05814 226 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4Q2P0C623 313 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 LAMP1P11279 417 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PSG2P11465 335 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF30P17039 623 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 FGF7P21781 194 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SRIP30626 198 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 EVX1P49640 407 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 THBS3P49746 956 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 LHX2P50458 406 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SYNJ2BPP57105 145 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 MAXP61244 160 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 GNA12Q03113 381 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 FZD2Q14332 565 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 MMDQ15546 238 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF404Q494X3 552 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 C6orf99Q4VX62 202 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 MESTQ5EB52 335 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR38Q5JTN6 314 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 LCE1EQ5T753 118 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 NXNL2Q5VZ03 156 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 LCN12Q6JVE5 192 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SBSNQ6UWP8 590 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 IGFL2Q6UWQ7 119 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 Q6ZSR6 202 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 NFE4Q86UQ8 179 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 STPG4Q8N801 248 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2T4Q8NH00 348 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5W2Q8NH69 310 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SCGB1C1Q8TD33 95 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 DCAKDQ8WVC6 231 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TWIST2Q8WVJ9 160 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PTX4Q96A99 478 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TM4SF18Q96CE8 201 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM101Q96IK0 257 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN32Q96QS1 320 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PAXXQ9BUH6 204 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PARP11Q9NR21 331 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC37Q6PGP7 1564 aa2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.73□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.73□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa2.73□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.73□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.73□□□□□ -1.97
SYF2P1-201ENST00000550658 K7N7A8 449 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms