RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TRIP11Q15643 1979 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF708P17019 499 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZN92 141 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 TIMP4Q99727 224 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM189A5PLL7 270 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 ADAP1O75689 374 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 RELBQ01201 579 aa7.31□□□□□ -1.24
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