RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 OR1P1Q8NH06 330 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM46BQ96A09 425 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CMBLQ96DG6 245 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 NUS1Q96E22 293 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TVP23CQ96ET8 276 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ACY3Q96HD9 319 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM210BQ96KR6 192 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 NMNAT3Q96T66 252 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 WFDC1Q9HC57 220 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CRLF2Q9HC73 371 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 MDFICQ9P1T7 246 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TAC3Q9UHF0 121 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 DKKL1Q9UK85 242 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A087WYN8 130 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1W2PN81 502 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 E5RGE8 158 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 K7EP13 123 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SPRY3O43610 288 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 NME2P1O60361 137 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CYTIPO60759 359 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CA11O75493 328 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 NKX2-2O95096 273 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OPN1MWP04001 364 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SERPINA7P05543 415 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 QDPRP09417 244 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 AKR1C4P17516 323 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 HNF1AP20823 631 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 PTNP21246 168 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 G0S2P27469 103 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 HSD11B1P28845 292 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 APLNRP35414 380 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CHRNA7P36544 502 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CDKN1BP46527 198 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OR3A1P47881 315 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CAMLGP49069 296 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 UBE2KP61086 200 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 UNC119Q13432 240 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF141Q15928 474 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 IQCJQ1A5X6 159 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 C1orf189Q5VU69 101 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 RTL6Q6ICC9 239 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF774Q6NX45 483 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 Q6ZSV7 163 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF550Q7Z398 422 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM156Q8N614 296 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 COX18Q8N8Q8 333 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 LRTM2Q8N967 370 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 OTOSQ8NHW6 89 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAFD1-204ENST00000548092 NT5CQ8TCD5 201 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms