RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC01560	Q8TB33	94 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD7	Q92527	254 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4K3	Q96R72	315 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RBBP8	Q99708	897 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CIB1	Q99828	191 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TFR2	Q9UP52	801 aa		2.58	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		F8VZ95	297 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	BPY2	O14599	106 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PSPHP1	O15172	72 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV2-8	P01709	118 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	APCS	P02743	223 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CRH	P06850	196 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	APLNR	P35414	380 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS2R31	P59538	309 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IFITM3	Q01628	133 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SSX8	Q7RTT4	187 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR86	Q86TI4	376 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	DRAM1	Q8N682	238 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX29	Q8N6K0	151 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CDS1	Q92903	461 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		Q96MT0	163 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIB3	Q96RU7	358 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MED18	Q9BUE0	208 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC6	Q9BV81	110 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		2.57	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		H0YGG7	62 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R1X1	148 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MANBA	O00462	879 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXH1	O75593	365 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RCBTB2	O95199	551 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DQB2	P05538	268 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PIRT	P0C851	137 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A16	P16260	332 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYGS	P22914	178 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	VSNL1	P62760	191 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IL5RA	Q01344	420 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFA6	Q01524	100 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NAB1	Q13506	487 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TMED2	Q15363	201 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC01551	Q86U37	167 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	GAPT	Q8N292	157 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8N7P7	452 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2M7	Q8NG81	312 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT81	Q8WYA0	676 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF382	Q96SR6	550 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		2.56	□□□□□ -2
SNHG1-222	ENST00000545308	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		2.56	□□□□□ -2

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