RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CD1B	P29016	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CRYBA2	P53672	197 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	UNC119	Q13432	240 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ABCA3	Q99758	1704 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	HYPM	O75409	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CCKAR	P32238	428 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SNX22	Q96L94	193 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RECK	O95980	971 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CRISP2	P16562	243 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IL19	Q9UHD0	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	KLF4	O43474	513 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SEC11C	Q9BY50	192 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	NPBWR2	P48146	333 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	DLL1	O00548	723 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	MC5R	P33032	325 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	GLIPR1	P48060	266 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SYNGR3	O43761	229 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SLC35B1	P78383	322 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	KLRB1	Q12918	225 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PTX4	Q96A99	478 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	VPS25	Q9BRG1	176 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	LINC00869	P0C866	280 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	SSTR5	P35346	364 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATE1-208	ENST00000540606	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	C1QL1	O75973	258 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	DLK1	P80370	383 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.39	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms