RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	WRB	O00258	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSD17B6	O14756	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPA12A	O43301	675 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MED6	O75586	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SCO1	O75880	301 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	LYZL6	O75951	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATG12	O94817	140 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	NXPH2	O95156	264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2H2	O95918	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SERPINE2	P07093	398 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	KITLG	P21583	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	F2R	P25116	425 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	GCH1	P30793	250 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	CAV2	P51636	162 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	F2RL1	P55085	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	DEFA5	Q01523	94 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	BAX	Q07812	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HMGN3	Q15651	99 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MSMO1	Q15800	293 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q6P435	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	GAPT	Q8N292	157 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808		F8W036	122 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPB6	O14558	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	KCNAB3	O43448	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDR1	O75083	606 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PITX3	O75364	302 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	RHBDL1	O75783	438 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	DFFB	O76075	338 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SNAPIN	O95295	136 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HAND1	O96004	215 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	CELA3B	P08861	270 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPP1	P10451	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	LMO1	P25800	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSG7	Q13046	419 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF154	Q13106	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF273	Q14593	569 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PEA15	Q15121	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	CDSN	Q15517	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q6ZPA2	131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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