RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSTR5P35346 364 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPRL1P41146 370 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM34P42696 430 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRISP1P54107 249 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2B8PP59922 312 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIPEQ05469 1076 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF91Q05481 1191 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKCDQ05655 676 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL24Q13007 206 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM183BQ1AE95 376 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKDD1AQ495B1 522 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MESTQ5EB52 335 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UTF1Q5T230 341 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MORN5Q5VZ52 161 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGIRRQ6IA17 410 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF662Q6ZS27 426 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCXRQ7Z4W1 244 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A42Q86VD7 318 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM183AQ8IXX5 376 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MICU2Q8IYU8 434 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR18Q8N4B5 295 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00311Q8N616 119 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM86B1Q8N7N1 296 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC57Q8N9N7 239 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8J2Q8NGG1 315 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10J6PQ8NGY7 276 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PFN4Q8NHR9 129 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM239Q8WW34 195 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLAMF9Q96A28 289 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 VPS33AQ96AX1 596 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TLCD1Q96CP7 247 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLAMF6Q96DU3 332 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRBF2Q96F24 287 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RITA1Q96K30 269 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q96M85 177 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q96MT0 163 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TXN2Q99757 166 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SULT4A1Q9BR01 284 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKIBQ9C010 78 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG12Q9UBI6 72 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GIMAP2Q9UG22 337 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIMS3Q9UJD0 308 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDH10Q9Y6N8 788 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5H14A6NHG9 310 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM159BA6NKW6 160 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFCAB9A8MZ26 197 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0QYG6 137 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFXANKO14593 260 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 AZIN1O14977 448 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEGS1O15121 323 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARPC2O15144 300 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST8SIA3O43173 380 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINT2O43291 252 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 YIF1AO95070 293 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPDEFO95238 335 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2H2O95918 312 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLEC3BP05452 202 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 H2BFMP0C1H6 154 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OCM2P0CE71 109 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-43DP0DP04 118 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALCBP10092 127 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFA4P12838 97 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFI30P13284 250 aa1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms