RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SOX15O60248 233 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 NAPSAO96009 420 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CT45A6P0DMU7 189 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CT45A5P0DMU8 189 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CT45A7P0DMV0 189 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CHRNA7P36544 502 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 UNC119Q13432 240 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 RCN1Q15293 331 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SETD6Q8TBK2 473 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 PHYHIPQ92561 330 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 TMED9Q9BVK6 235 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SLC23A1Q9UHI7 598 aa13.11□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 FCN1O00602 326 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 RRHO14718 337 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 OVOL1O14753 267 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 RAB29O14966 203 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CX3CL1P78423 397 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 PLGLAQ15195 96 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF429Q86V71 674 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 ISYNA1Q9NPH2 558 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 A0A0A6YYD4 124 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 OR5H14A6NHG9 310 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SAP30O75446 220 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CDK1P06493 297 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SRMP19623 302 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SLURP1P55000 103 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 QRFPP83859 136 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM19Q7Z692 300 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 MND1Q9BWT6 205 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 LINC01619G3V211 115 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 H0YJW9 148 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 H7C2Y5 167 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A1O15245 554 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-211ENST00000513325 HSD17B12Q53GQ0 312 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 ABHD5Q8WTS1 349 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 AGMATQ9BSE5 352 aa13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-211ENST00000513325 A0A087WW49 117 aa13.07□□□□□ -0.32
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HERC3-211ENST00000513325 CD37P11049 281 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM6P40199 344 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 SPHARQ15513 63 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 RNLSQ5VYX0 342 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 CLCC1Q96S66 551 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 AK3Q9UIJ7 227 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 GAB2Q9UQC2 676 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 ITGB1BP1O14713 200 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 SOCS1O15524 211 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 RBBP9O75884 186 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-11P01762 117 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 UCHL1P09936 223 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 SPNP16150 400 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB25P24278 435 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 P2RY14Q15391 338 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-211ENST00000513325 MED22Q15528 200 aa13.06□□□□□ -0.32
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