RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 MPDZO75970 2070 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1B0GW64 132 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 MMP23AO75900 390 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 MS4A10Q96PG2 267 aa6.21□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 F5H5K5 113 aa6.21□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DRB3P79483 266 aa6.21□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.21□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.21□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 POC1AQ8NBT0 407 aa6.2□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.2□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 ACY3Q96HD9 319 aa6.2□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.2□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 CD1AP06126 327 aa6.19□□□□□ -1.42
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ROBO1-211ENST00000498428 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.19□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 FUT9Q9Y231 359 aa6.19□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.19□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.19□□□□□ -1.42
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1B0GU03 582 aa6.19□□□□□ -1.42
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