RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUPR1	O60356	82 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLC1	P0CG04	106 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF83	P51522	516 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP2	Q05923	314 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMF	Q96LC9	184 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM206A	Q9NX38	181 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DS4	P43632	304 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DS1	Q14954	304 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4C12	Q96R67	309 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCN2A	Q99250	2005 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NGFR	P08138	427 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXB2	P14652	356 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FUT7	Q11130	342 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSX8	Q7RTT4	187 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	BLNK	Q8WV28	456 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PR80	420 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBZ	P02008	142 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	POU2F2	P09086	479 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QTNF9	P0C862	333 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HERV-K104	P63124	156 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTC32	Q5I0X7	151 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C18orf12	Q96KH6	178 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2V2	Q96R30	315 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPY	P01298	95 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35E2	P0CK97	266 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LGALS7	P47929	136 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNG5	Q9UF02	275 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	MCM3AP	O60318	1980 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PP11	408 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTLA4	P16410	223 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEBPB	P17676	345 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXF1	Q12946	379 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE5	Q13069	117 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE6	Q13070	117 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SGCB	Q16585	318 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCN5A	Q14524	2016 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKX2-2	O95096	273 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	REG1A	P05451	166 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIPF	P07098	398 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSB	P07858	339 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLL1	P15814	213 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35B1	P78383	322 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX29	Q8N6K0	151 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF479	Q96JC4	524 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A1L4Q6	167 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMB11	A5LHX3	300 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGR1	P18146	543 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28

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