RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PRORY	Q9H606	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NLC8	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		E5RGE8	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		K7EPK0	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		K7N7A8	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB6	O14558	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	BET1	O15155	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF16	O43320	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TSC22D2	O75157	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HBZ	P02008	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RLN2	P04090	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ELANE	P08246	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		P0C879	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CGB3	P0DN86	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CGB7	P0DN87	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HKR1	P10072	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GZMH	P20718	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	VDAC1	P21796	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRNB4	P30926	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RY1	P47900	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CASP6	P55212	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB14	P61106	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	COL10A1	Q03692	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SP6	Q3SY56	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	STUM	Q69YW2	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GALM	Q96C23	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GU03	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ODAM	A1E959	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR137B	O60478	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	YPEL1	O60688	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF134	P52741	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RX3	P56373	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	POLE	Q07864	2286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		Q3ZCU0	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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