RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX261Q6UWH6 196 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR51H1Q8NH63 302 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 GPHA2Q96T91 129 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFP57Q9NU63 452 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 GNG12Q9UBI6 72 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4Q9UBX2 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 U3KQ87 197 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS13CQ709C8 3753 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCE1Q9P212 2302 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DYSFO75923 2080 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 hADV38S2A0JD32 116 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF222A6NCQ9 220 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TMPRSS2O15393 492 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL2L11O43521 198 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 YPEL1O60688 119 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V1G1O75348 118 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNA7P01567 189 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RLN2P04090 185 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CGB3P0DN86 165 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CGB7P0DN87 165 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 VDAC1P21796 283 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LTC4SQ16873 150 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1S1Q8NH92 325 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CORO2AQ92828 525 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 YPEL2Q96QA6 119 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CLN8Q9UBY8 286 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF150Q9ULK6 438 aa8.6□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGB1BP1O14713 200 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAM20O43506 726 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFB3O43676 98 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA2O43678 99 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DEDDO75618 318 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SCGB1D2O95969 90 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFB7P17568 137 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IGFBP2P18065 325 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CATR1Q13166 79 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MORN2Q502X0 79 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NMSQ5H8A3 153 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TCF23Q7RTU1 214 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC51BQ86UW2 128 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 AQP10Q96PS8 301 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PSG11Q9UQ72 335 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.59□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNA1DQ01668 2161 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 HCFC1P51610 2035 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EPK0 472 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ST8SIA5O15466 376 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ST8SIA3O43173 380 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 FSTL3O95633 263 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 HTR2BP41595 481 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR12P47775 334 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB7AP51149 207 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 LOXL3P58215 753 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM219AQ8IW50 185 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf30Q96GV9 206 aa8.58□□□□□ -1.04
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