RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SH2D1BO14796 132 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FCN3O75636 299 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CLPXO76031 633 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 HAND1O96004 215 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV2-70P01814 119 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AMBPP02760 352 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 UBBP0CG47 229 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 S100A5P33763 92 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 J3QRK9 145 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 PYDC2Q56P42 97 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.85□□□□□ -1.79
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