RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR52N5Q8NH56 324 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF596Q8TC21 504 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C10orf35Q96D05 121 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR4F4Q96R69 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RAB40CQ96S21 281 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SIGMAR1Q99720 223 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RSG1Q9BU20 258 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10A2Q9H208 303 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 A0A0U1RQK1 487 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF320A2RRD8 509 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM202A6NGA9 273 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C4orf47A7E2U8 309 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 M0R1X1 148 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MT-ATP6P00846 226 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DQA2P01906 255 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GYPAP02724 150 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF728P0DKX0 622 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GPM6AP51674 278 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DPTQ07507 201 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CST9LP1Q5W188 147 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM215Q68D42 235 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 STUMQ69YW2 141 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LCN10Q6JVE6 187 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RASL11AQ6T310 242 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DPF1Q92782 380 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 KCNS1Q96KK3 526 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DEC1Q9P2X7 70 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RNF24Q9Y225 148 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 VDAC3Q9Y277 283 aa6.11□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 IGSF23A1L1A6 192 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LRP5LA4QPB2 252 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 B5MCH6 92 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 H0YJW9 148 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SERF1AO75920 110 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PSG1P11464 419 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DRD1P21728 446 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TUBG1P23258 451 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPY1RP25929 384 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GRPRP30550 384 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SRD5A2P31213 254 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CD70P32970 193 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CYB561P49447 251 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF134P52741 427 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM50BP56557 158 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PIGPP57054 158 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HBG1P69891 147 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HBG2P69892 147 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LRP11Q86VZ4 500 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 BAGE3Q86Y29 109 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 BAGE2Q86Y30 109 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NT5CQ8TCD5 201 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 BORCS7Q96B45 105 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SFRP2Q96HF1 295 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.1□□□□□ -1.43
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