RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478227.5

SUPV3L1-204, Transcript of Suv3 like RNA helicase, human

TSL 5

Gene SUPV3L1, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUPV3L1-204	ENST00000478227	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TBX5	Q99593	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		Q9N2K0	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		A0A1W2PP11	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		E9PQ18	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		H3BSH0	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	GYG2	O15488	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	OR2F2	O95006	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	MT-ND2	P03891	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ISG15	P05161	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CSN2	P05814	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	BCL3	P20749	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	GABRR1	P24046	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	LMO1	P25800	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	POU3F4	P49335	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ATP1B3	P54709	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CDC42	P60953	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	SST	P61278	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZNF85	Q03923	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	COQ2	Q96H96	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CIB1	Q99828	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TNC	P24821	2201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		A0A1W2PPK0	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		G3V2T6	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227		J3QRE1	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	OR2H2	O95918	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CGB3	P0DN86	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CGB7	P0DN87	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	RRAS	P10301	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ATF1	P18846	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CDK2	P24941	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	CD24	P25063	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	BRS3	P32247	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	GLIPR1	P48060	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	RASSF2	P50749	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	SLC35A2	P78381	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	AES	Q08117	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUPV3L1-204	ENST00000478227	UTF1	Q5T230	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms