RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463004.5

RBM39-223, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 5

Gene RBM39, Length 4,580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-223	ENST00000463004	OR5G3	P0C626	314 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	LGALS7	P47929	136 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TCF15	Q12870	199 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	MMD2	Q8IY49	270 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	F2RL2	O00254	374 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SERF2	P84101	59 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	LEUTX	A8MZ59	168 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NPBWR1	P48145	328 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SPRY4	Q9C004	299 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PROB1	E7EW31	1015 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CD8A	P01732	235 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ZP1	P60852	638 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	UBE2G1	P62253	170 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	STPG2	Q8N412	459 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	OR5T1	Q8NG75	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	HLA-G	P17693	338 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NPY1R	P25929	384 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	OR1L1	Q8NH94	360 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	DEDD	O75618	318 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	OPRK1	P41145	380 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NHLH1	Q02575	133 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	AQP10	Q96PS8	301 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	OR7C2	O60412	319 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TECTA	O75443	2155 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ZNF727	A8MUV8	499 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PPP1R2P9	O14990	202 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CEACAM4	O75871	244 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TMEM187	Q14656	261 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CT45A10	P0DMU9	189 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CA7	P43166	264 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ACY3	Q96HD9	319 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004		J3QR06	171 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	UCP1	P25874	307 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	DYNLT3	P51808	116 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ZNF146	Q15072	292 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TNXA	Q16473	311 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ASCL4	Q6XD76	172 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	YIF1A	O95070	293 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	IGKV3-15	P01624	115 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	HTR1D	P28221	377 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	WNT5A	P41221	380 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	S100A12	P80511	92 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	AANAT	Q16613	207 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	GUK1	Q16774	197 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	BVES	Q8NE79	360 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	PARP11	Q9NR21	331 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ACACA	Q13085	2346 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004		H7BYZ3	331 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RBM39-223	ENST00000463004	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81

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