RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 COA4Q9NYJ1 87 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 GAB2Q9UQC2 676 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM157AC9JC47 383 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF12O43508 249 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 JTBO76095 146 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR8U9P0C7N5 309 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SPP1P10451 314 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SELLP14151 372 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CD80P33681 288 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 EFNB3Q15768 340 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 BTNL8Q6UX41 500 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR8U1Q8NH10 309 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 GALMQ96C23 342 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf79Q96F83 325 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 LINC00473A8K010 186 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf98A8MV24 154 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT19A8MXV4 375 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 E7EQL1 145 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 I3L521 148 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ABCD4O14678 606 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC5O15389 551 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 PPIHO43447 177 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SPRY3O43610 288 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 SEC11BP0C7V7 166 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DANCRP0C864 163 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 EPHA1P21709 976 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 GABRA2P47869 451 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ASCL1P50553 236 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF134P52741 427 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R30P59541 319 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 NHLH2Q02577 135 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 KLRB1Q12918 225 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SMCO1Q147U7 214 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CDSNQ15517 529 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.67□□□□□ -1.66
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