RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	RGS5	O15539	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FABP7	O15540	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SPINT2	O43291	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SCT	P09683	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PTHLH	P12272	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TBP	P20226	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	S100A5	P33763	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SSTR5	P35346	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GLP1R	P43220	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GNG2	P59768	71 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	AANAT	Q16613	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MORN2	Q502X0	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GALM	Q96C23	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SMR3A	Q99954	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TNC	P24821	2201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731		J3QR06	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	LANCL1	O43813	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PROP1	O75360	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RBBP9	O75884	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GYPE	P15421	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OMG	P23515	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZBTB25	P24278	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CD40LG	P29965	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RCVRN	P35243	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	DYNLT3	P51808	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PPP5C	P53041	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTB	P60709	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTG1	P63261	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXI1	Q12951	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MSMO1	Q15800	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms