RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LY6EQ16553 131 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HLA-DQB1P01920 261 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IFITM3Q01628 133 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PLXNB2O15031 1838 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HAX1O00165 279 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SIGLEC5O15389 551 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GFRA1P56159 465 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CORTO00230 105 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 C1QL1O75973 258 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 OR4A5Q8NH83 315 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 REG1AP05451 166 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF735P0CB33 412 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 RBKSQ9H477 322 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 FAM106CPP0CH98 169 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CTSSP25774 331 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ARF6P62330 175 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PTX4Q96A99 478 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 C16orf92Q96LL3 132 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SSTR5P35346 364 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 OR4C46A6NHA9 309 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SEC11BP0C7V7 166 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CXCL2P19875 107 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 NUBP1P53384 320 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HERVK_113P61574 105 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 BET1LQ9NYM9 111 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 FSTP19883 344 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.79□□□□□ -0.04
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A17O43808 307 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GFRA3O60609 400 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LINC00869P0C866 280 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 OR8G5Q8NG78 346 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 DIRC2Q96SL1 478 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.79□□□□□ -0.04
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PTPRF-209ENST00000438120 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.79□□□□□ -0.04
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PTPRF-209ENST00000438120 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 NDUFB4O95168 129 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 UNC119Q13432 240 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PCOLCEQ15113 449 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 WNT2BQ93097 391 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 RHOVQ96L33 236 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 H0Y980 276 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TBX15Q96SF7 602 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IL19Q9UHD0 177 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 DEDDO75618 318 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 DLX1P56177 255 aa14.78□□□□□ -0.04
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PTPRF-209ENST00000438120 TM4SF20Q53R12 229 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.78□□□□□ -0.04
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PTPRF-209ENST00000438120 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 H3BTX0 84 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 MFAP2P55001 183 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 MIC13Q5XKP0 118 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF738Q8NE65 137 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CALYQ9NYX4 217 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3-48P01763 117 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 AREGP15514 252 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 FAM206AQ9NX38 181 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 NPBWR2P48146 333 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 LINC01560Q8TB33 94 aa14.77□□□□□ -0.05
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