RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 TMEM189A5PLL7 270 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 NAT2P11245 290 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CD40P25942 277 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SAP25Q8TEE9 199 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 J3KRW8 73 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SIAH2O43255 324 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 POM121Q96HA1 1249 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TRIP11Q15643 1979 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 A8MWL6 223 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 WNT9BO14905 357 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PSG9Q00887 426 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SMIM10Q96HG1 83 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RBKSQ9H477 322 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CD99P14209 185 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 REG1BP48304 166 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PKIAP61925 76 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 FHL5Q5TD97 284 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 FAM206AQ9NX38 181 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 GREM1O60565 184 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 IGSF11Q5DX21 431 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 JPT1Q9UK76 154 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 A0A1W2PPE3 182 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 A0A087X0M5 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 A0A1B0GX30 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CDK2AP1O14519 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 COX6A1P12074 109 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 UBE2V2Q15819 145 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 HLA-DQB1P01920 261 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CCL8P80075 99 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TMEM54Q969K7 222 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 MIOXQ9UGB7 285 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TWIST1Q15672 202 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 HTN1P15515 57 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CELA2AP08217 269 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 APELAP0DMC3 54 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 FCARP24071 287 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 IFITM10A6NMD0 228 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CD300CQ08708 224 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SLC25A45Q8N413 288 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 SCTP09683 121 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PCSK4Q6UW60 755 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CALYQ9NYX4 217 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 C16orf92Q96LL3 132 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 CXCL2P19875 107 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 RELBQ01201 579 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-207ENST00000430930 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms