RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPPA5A6NC42 116 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDLRAD4O15165 306 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YPEL1O60688 119 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS11O94810 467 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAS1P04201 325 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLAP06280 429 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUT3P21217 361 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCKP27707 260 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPD6Q86Y78 171 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GHSRQ92847 366 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q96M66 194 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YPEL2Q96QA6 119 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C12Q96R67 309 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL15Q9H469 300 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BABAM2Q9NXR7 383 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.14□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QL48 77 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD6O75340 191 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-11P01762 117 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR14A2Q96R54 314 aa10.13□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRHO14718 337 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA12AO43301 675 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL12AP19105 171 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CX3CL1P78423 397 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR20EP86478 221 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR20CP86479 221 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR20DP86480 221 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR20BP86481 221 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR20AP86496 221 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLGLAQ15195 96 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGN3Q15651 99 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC23Q5W5X9 447 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH26Q8IXH8 852 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALMQ96C23 342 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF150Q9ULK6 438 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.12□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPK0 400 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRGMA1A4Y4 181 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5H14A6NHG9 310 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MZ25 164 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST8SIA5O15466 376 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM18P0DKX4 95 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPPP2P59282 170 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTBL2Q562R1 376 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N1Y9 231 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM46BQ96A09 425 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STUB1Q9UNE7 303 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.11□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV1-51P01701 117 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNAO1P09471 354 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT45A6P0DMU7 189 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT45A5P0DMU8 189 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT45A7P0DMV0 189 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VEGFCP49767 419 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOVQ96L33 236 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A10Q96PG2 267 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms