RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR12	P47775	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF134	P52741	427 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	DLX1	P56177	255 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PIGP	P57054	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	MSMO1	Q15800	293 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	BVES	Q8NE79	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964		B4DSR2	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC22A5	O76082	557 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	IL5	P05113	134 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	VAMP1	P23763	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	COX7A1	P24310	79 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	S100G	P29377	79 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	RND3	P61587	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	DHRS2	Q13268	280 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964		J3QR06	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TNFSF12	O43508	249 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	MMP9	P14780	707 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PRTN3	P24158	256 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	DHODH	Q02127	395 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CBX3	Q13185	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PNKD	Q8N490	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TOR1A	O14656	332 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	RAB29	O14966	203 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	MPPED1	O15442	326 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	TOX4	O94842	621 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SFT2D2	O95562	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8

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