RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00473A8K010 186 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 AHRRA9YTQ3 701 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 APLNRP35414 380 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CTRLP40313 264 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNLT3P51808 116 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM210BQ96KR6 192 aa3.03□□□□□ -1.92
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PGGT1B-203ENST00000419445 VWC2LB2RUY7 222 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HS3ST1O14792 307 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FCN3O75636 299 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
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PGGT1B-203ENST00000419445 COL12A1Q99715 3063 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF785A8K8V0 405 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BP45 60 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf65H3BRN8 121 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA21P01568 189 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL3P20749 454 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS4P43632 304 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXF2Q12947 444 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS1Q14954 304 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BSXQ3C1V8 233 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QW42 95 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53I11O14683 189 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FSTL3O95633 263 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PSG2P11465 335 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OMGP23515 440 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MPLP40238 635 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF383Q8NA42 475 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB40CQ96S21 281 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.03□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RELNP78509 3460 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB11A5LHX3 300 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf77C9JDV5 145 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-CO3P00414 261 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 REC114Q7Z4M0 266 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 GPER1Q99527 375 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 VAX2Q9UIW0 290 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 WRBO00258 174 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RAMP3O60896 148 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2C1O95371 312 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF503Q96F45 646 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD4P59646 89 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 DERL1Q9BUN8 251 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1B-203ENST00000419445 DYSFO75923 2080 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ODAMA1E959 279 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QT63 122 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ST8SIA5O15466 376 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV2-8P01709 118 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00205P59089 165 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SMCO1Q147U7 214 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RSU1Q15404 277 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MSMO1Q15800 293 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.02□□□□□ -1.93
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