RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACTR1BP42025 376 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAS2R30P59541 319 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AP1S1P61966 158 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM3AP98173 230 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DMTNQ08495 405 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDE6HQ13956 83 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NXNL2Q5VZ03 156 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDR9C7Q8NEX9 313 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHST6Q9GZX3 395 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR51B5Q9H339 312 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB20Q9NX57 234 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNF11Q9Y3C5 154 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PIK3R4Q99570 1358 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A1B0GWJ7 208 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUPR2A6NF83 97 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BSA7 217 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TXNDC9O14530 226 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIVA1O15304 175 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR1I1O60431 355 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALOX12BO75342 701 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPRR2AP35326 72 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARL2P36404 184 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSPA13P48723 471 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINB9P50453 376 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GTF2BQ00403 316 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BSPH1Q075Z2 132 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF846Q147U1 533 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM31Q5JXX7 168 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RUFY3Q7L099 469 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ING5Q8WYH8 240 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GALMQ96C23 342 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERP27Q96DN0 273 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACER3Q9NUN7 267 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR51B2Q9Y5P1 312 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPTBN2O15020 2390 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATRQ13535 2644 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A0J9YW62 118 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC00862A6NCI5 91 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAL4O96015 105 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AK1P00568 194 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RLN2P04090 185 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYBA1P05813 215 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANXA5P08758 320 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TACSTD2P09758 323 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNNI1P19237 187 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPOP30536 169 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OPRM1P35372 400 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBX5P45973 191 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STC1P52823 247 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BPIFB3P59826 476 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB10P61026 200 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ITFG1Q8TB96 612 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DTD1Q8TEA8 209 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CAPSLQ8WWF8 208 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RASSF5Q8WWW0 418 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMF1Q92530 271 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPPP3Q9BW30 176 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C6orf50Q9HD87 102 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD209Q9NNX6 404 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMCO2A6NFE2 343 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 K7EQS6 105 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SNNO75324 88 aaPredicted RBP-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHRS3O75911 302 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5F1O95221 314 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMG1O95456 288 aa-1.42□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms