RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCML1Q9UN30 329 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FIS1Q9Y3D6 152 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01619G3V211 115 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFXANKO14593 260 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 KINO60870 393 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV1-51P01701 117 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPBPP02775 128 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBA1P05813 215 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FABP6P51161 128 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX1BP61266 288 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOGP84095 191 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PJVKQ0ZLH3 352 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCARB2Q14108 478 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIAQ16674 131 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKDD1AQ495B1 522 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSM3Q53FZ2 586 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM180BQ6P0A1 224 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL23Q86XA0 190 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF148Q8N7C7 305 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCORP1Q8N888 145 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM71CQ8NEG0 241 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPCAT1Q8NF37 534 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5B17Q8NGF7 314 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52K1Q8NGK4 314 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLFM3Q96PB7 478 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANAPC13Q9BS18 74 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRG3Q9BZD7 231 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM10Q9UDY6 481 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITPNC1Q9UKF7 332 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RELNP78509 3460 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 USF3Q68DE3 2245 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNPLA6Q8IY17 1366 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6C6A6NF89 314 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BT86 120 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHRS3O75911 302 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINE2P07093 398 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS4P49798 205 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB7AP51149 207 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 BPIFB3P59826 476 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB14P61106 215 aa-2.57□□□□□ -2.82
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB135Q30KP9 77 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PET117Q6UWS5 81 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-2.57□□□□□ -2.82
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TYMSP04818 313 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB4AP20338 218 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTNP21246 168 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBB3P26998 211 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V0CP27449 155 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FXYD2P54710 66 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRCC4Q13426 336 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAMTQ14353 236 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAHD1Q6P587 224 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASC2Q6XLA1 102 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF8Q7Z7C8 310 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5K2Q8NHB8 316 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHP1Q99653 195 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLZF1Q9H2G9 400 aa-2.58□□□□□ -2.82
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