RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 TESK1Q15569 626 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PKDCCQ504Y2 493 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM42Q69YG0 159 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF645Q8N7E2 425 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPEQ96AT9 228 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PELI1Q96FA3 418 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL21Q9HBE4 155 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIGD1BQ9P298 99 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLK11Q9UBX7 282 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCN5AQ14524 2016 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 K7EP34 96 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 NDUFS4O43181 175 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TM4SF18Q96CE8 201 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPATA33Q96N06 139 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PBOV1Q9GZY1 135 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 R4GMQ9 66 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 V9GYY9 64 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR2T8A6NH00 312 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 WNT1P04628 370 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 VPREB1P12018 145 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR13A1Q8NGR1 328 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RHOVQ96L33 236 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 Q96M85 177 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR35Q9HC97 309 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRPM6Q9BX84 2022 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 C2orf72A6NCS6 295 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL3RAP26951 378 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRRT3Q5FWE3 981 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR10D3Q8NH80 312 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIFOQ8TCI5 191 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM56Q96MV1 263 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 AICDAQ9GZX7 198 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRO1933Q9H354 126 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCNX2A6NKB5 2137 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 LINC01387J3KSC0 135 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 LAMTOR5O43504 91 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 IGLC2P0DOY2 106 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 IGLC3P0DOY3 106 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RTP3Q9BQQ7 232 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL36BQ9NZH7 164 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 DOCK7Q96N67 2140 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 APCSP02743 223 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TDGF1P13385 188 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABHD17BQ5VST6 288 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAAP20Q6NZ36 180 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 NPNTQ6UXI9 565 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 RFLNBQ8N5W9 214 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 UFC1Q9Y3C8 167 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 MOSP00540 346 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 C8orf88P0DMB2 117 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP2CBP62714 309 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP2CAP67775 309 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 HBBP68871 147 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEX36Q5VZQ5 186 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 DRAM1Q8N682 238 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 INSL5Q9Y5Q6 135 aa3□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 NUP205Q92621 2012 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 LPAR6P43657 344 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR4X1Q8NH49 305 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0U1RQV1 116 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 E9PQ18 207 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 M0QZ24 198 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 CFIP05156 583 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 PSMB5P28074 263 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF595Q8IYB9 648 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 LIPHQ8WWY8 451 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 VGLL1Q99990 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.99□□□□□ -1.93
PKHD1L1-201ENST00000378402 SAMD5Q5TGI4 173 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms