RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM235A6NFC5 223 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5K4A6NMS3 321 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0QYV0 167 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHYHO14832 338 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC172P0C7W6 258 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 LIMS3P0CW19 117 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 LIMS4P0CW20 117 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF728P0DKX0 622 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 NQO2P16083 231 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRYBB3P26998 211 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAGEA12P43365 314 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINB10P48595 397 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAP1GDS1P52306 607 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUMA1Q14980 2115 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCZ1Q86YW0 608 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 C10orf126Q8N4M7 172 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RORBQ92753 470 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MSANTD3Q96H12 275 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD14BQ96IU4 210 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM210AQ96ND0 272 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 HBEGFQ99075 208 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED28Q9H204 178 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 COMMD9Q9P000 198 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 HHLA2Q9UM44 414 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM215AQ9Y5M1 114 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLUHO75153 1309 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF532Q9HCE3 1301 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSCAMO60469 2012 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC88CQ9P219 2028 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA0232Q92628 1395 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf74A8MZ97 194 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 UGT2B11O75310 529 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV3-27P01718 113 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 GP1BAP07359 652 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD7P09564 240 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35E2BP0CK96 405 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13C7P0DN81 318 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP6V0CP27449 155 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 DAPP51397 102 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMD7P51665 324 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERHP84090 104 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 STX3Q13277 289 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 LHFPL5Q8TAF8 219 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC127Q96BQ5 260 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM56Q96MV1 263 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINB11Q96P15 392 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNB1LQ9BYB4 327 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 DISP1Q96F81 1524 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RFPL4AA6NLU0 287 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR11H12B2RN74 326 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SULT1C2O00338 296 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC17A3O00476 420 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK16O75716 305 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFAIP8O95379 198 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRI3O95415 125 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 FADS2O95864 444 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASS1P00966 412 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV1-69P01742 117 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 IVLP07476 585 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 XCL1P47992 114 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNJ3P48549 501 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RELAQ04206 551 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4D1Q15615 310 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM31Q5JXX7 168 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC112Q8NEF3 446 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR11H2Q8NH07 326 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51H1Q8NH63 302 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 C10orf105Q8TEF2 133 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACY3Q96HD9 319 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIEN1Q9BRT3 115 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 UGT2B28Q9BY64 529 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 BABAM2Q9NXR7 383 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV41A0A0B4J266 112 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPZL2O60487 215 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QCP02747 245 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADORA1P30542 326 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC38A11Q08AI6 406 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 XRCC4Q13426 336 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSP90B2PQ58FF3 399 aa0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.1 ms