RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 NAAAQ02083 359 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE6DO43924 150 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V0CP27449 155 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CD1BP29016 333 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H3AP68431 136 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 IGSF23A1L1A6 192 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 THY1P04216 161 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PMCHP20382 165 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CD300CQ08708 224 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM222BQ8WU58 562 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP11Q9NR21 331 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 JPT1Q9UK76 154 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM157CP0CG43 387 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 APELAP0DMC3 54 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT2P11245 290 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM218A2RU14 115 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 LEUTXA8MZ59 168 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIC3O60481 467 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MPDU1O75352 247 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CELA3AP09093 270 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF708P17019 499 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC15Q8N387 334 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 STPG2Q8N412 459 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENOTP62341 195 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 LTBP1Q14766 1721 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RAMP1O60894 148 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 COL8A1P27658 744 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FADS6Q8N9I5 356 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD4Q96DR4 205 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T8A6NH00 312 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 B4DEV8 164 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMPP49913 170 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UMODP07911 640 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FABP4P15090 132 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 AMTP48728 403 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IFITM3Q01628 133 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ACACAQ13085 2346 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF9O60383 454 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PAGE4O60829 102 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HYPMO75409 117 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 P01737 135 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RANP62826 216 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5J2P56134 94 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC11CQ9BY50 192 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GFRA1P56159 465 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR9G1Q8NH87 305 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RABAC1Q9UI14 185 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RTTNQ86VV8 2226 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PGA5P0DJD9 388 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35B1P78383 322 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf48Q6RUI8 117 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf42Q8N5U0 333 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5P3Q8WZ94 311 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LURAP1Q96LR2 239 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HELTA6NFD8 242 aa14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms