RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GNG12Q9UBI6 72 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 FBXL17Q9UF56 701 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 RNF212BA8MTL3 300 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1-5P01602 117 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-7P01780 117 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 LPAR6P43657 344 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 P2RY1P47900 373 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 LOXL3P58215 753 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZRM9 215 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CCL17Q92583 94 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 AGMATQ9BSE5 352 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 TMEM178BH3BS89 294 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TEX46H3BTG2 121 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LGALS8O00214 317 aa14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 TAAR5O14804 337 aa14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 UTF1Q5T230 341 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GU03 582 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 B8ZZF3 427 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 B9A039 149 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 YPEL1O60688 119 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PITX3O75364 302 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 NHLH2Q02577 135 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 Q3ZCU0 254 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 GPR157Q5UAW9 335 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TCF23Q7RTU1 214 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LRRC46Q96FV0 321 aa14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 REG4Q9BYZ8 158 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 C17orf98A8MV24 154 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PPIAL4DF5H284 164 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 AANATQ16613 207 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TMED6Q8WW62 240 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LEAP2Q969E1 77 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 WFDC1Q9HC57 220 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 LINC00473A8K010 186 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 CLDN14O95500 239 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A6P12236 298 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 NDUFB7P17568 137 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 AKR1C2P52895 323 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-201ENST00000331789 CLN8Q9UBY8 286 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 CACNG5Q9UF02 275 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 CHST1O43916 411 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PROP1O75360 226 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TMEM50AO95807 157 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 GPR12P47775 334 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 TFF3Q07654 80 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 CATR1Q13166 79 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 OR2C3Q8N628 320 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 MED9Q9NWA0 146 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 IGSF23A1L1A6 192 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 SLC31A2O15432 143 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 FCN3O75636 299 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-201ENST00000331789 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
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