RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPTSSAQ969W0 71 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC25A22Q9H936 323 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 S100GP29377 79 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TLE1Q04724 770 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF738Q8NE65 137 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGLC2P0DOY2 106 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGLC3P0DOY3 106 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IAPPP10997 89 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q0VG73 95 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NSDHLQ15738 373 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATA45Q537H7 98 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACSM6Q6P461 480 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCF23Q7RTU1 214 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF709Q8N972 641 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q8N976 141 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STRADBQ9C0K7 418 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COX11Q9Y6N1 276 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAGE4O60829 102 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TIAF1O95411 115 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTXN2P0C2S0 81 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPPCP23582 126 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C10orf128Q5T292 105 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM42Q69YG0 159 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR5T1Q8NG75 326 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SEC16AO15027 2179 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AQP7O14520 342 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE6DO43924 150 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLB1P16278 677 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2G2P60604 165 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q6ZRM9 215 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SFRP2Q96HF1 295 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TXN2Q99757 166 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZPBPQ9BS86 351 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIRC3C9JPN6 131 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C11orf94C9JXX5 98 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HYPMO75409 117 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBR3O75828 277 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SERPINE2P07093 398 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXW4P57775 412 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM122AQ96E09 287 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CACNG5Q9UF02 275 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAPSAO96009 420 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCTP09683 121 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIR2DS4P43632 304 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLDN17P56750 224 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIR2DS1Q14954 304 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLPPR5Q32ZL2 321 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q6ZN92 141 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NABP1Q96AH0 204 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD300LBA8K4G0 201 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms