RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01590Q5TEZ4 76 aa18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 WDR31Q8NA23 367 aa18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 A8MWL6 223 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MC5RP33032 325 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP2P55001 183 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 POM121Q96HA1 1249 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SAXO1Q8IYX7 474 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 GBGT1Q8N5D6 347 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF714Q96N38 554 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R17PQ8TDU5 208 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPE3 182 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB13A6NJU9 1138 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB4C9JG80 1138 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CFDP00746 253 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PAM16Q9Y3D7 125 aa18.26■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RHOVQ96L33 236 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A1P02462 1669 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 DIRC3C9JPN6 131 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 LMX1BO60663 402 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 C1QL1O75973 258 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SPTA1P02549 2419 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CD74P04233 296 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CELA2AP08217 269 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TPRX1Q8N7U7 411 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 H2BFSP57053 126 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SPRED2Q7Z698 418 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 G6PC2Q9NQR9 355 aa18.25■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB4O95168 129 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RPL24P83731 157 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 IFITM2Q01629 132 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TBX15Q96SF7 602 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 COX5BP10606 129 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PQLC2Q6ZP29 291 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM18A8MTB9 384 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 REG1BP48304 166 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MYOZ3Q8TDC0 251 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 Q96M66 194 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf66Q9H5L9 145 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 KCNMB2Q9Y691 235 aa18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MARVELD3Q96A59 401 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 AHRRA9YTQ3 701 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 IGHMP01871 453 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 STAG3L2P0CL84 134 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB2P49721 201 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ERVFRD-1P60508 538 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 FGFRL1Q8N441 504 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 IFITM10A6NMD0 228 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CALHM1Q8IU99 346 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 GPR146Q96CH1 333 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 DDA1Q9BW61 102 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RBKSQ9H477 322 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 UNC13CQ8NB66 2214 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PRR33A8MZF0 331 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A4O95047 310 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A7Q96R45 310 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 DLL3Q9NYJ7 618 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDL1O75783 438 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF735P0CB33 412 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CCL8P80075 99 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM14Q9GZV8 571 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM14DPA8MWL7 114 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF137PP52743 207 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 NHLRC3Q5JS37 347 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A45Q8N413 288 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CCL13Q99616 98 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 OR8A1Q8NGG7 326 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf65A6NEN9 183 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 AP5S1Q9NUS5 200 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 213.4 ms