RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 YKT6O15498 198 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SMPD2O60906 423 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TRGC2P03986 189 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OPN1MWP04001 364 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DS4P43632 304 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TFF3Q07654 80 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DS1Q14954 304 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF573Q86YE8 665 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CDH20Q9HBT6 801 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C5orf52A6NGY3 159 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C12orf77C9JDV5 145 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SYNGR2O43760 224 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZG16O60844 167 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGHEP01854 428 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MYOD1P15172 320 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TGFBR3Q03167 851 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF266Q14584 549 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR8G1Q15617 311 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 STX12Q86Y82 276 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DEFB124Q8NES8 71 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SDSLQ96GA7 329 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IFITM10A6NMD0 228 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 LY86O95711 162 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CRYAAP02489 173 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MT-ND4LP03901 98 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HOXA6P31267 233 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ARR3P36575 388 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UBE2G2P60604 165 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MSMPQ1L6U9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ATP5SQ99766 215 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ABI3Q9P2A4 366 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PSG11Q9UQ72 335 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZFHX3Q15911 3703 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 H0Y980 276 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HAND1O96004 215 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HEXAP06865 529 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 Q3ZCU0 254 aa7.29□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RBKSQ9H477 322 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HCFC1P51610 2035 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.28□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 NUDT19A8MXV4 375 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IL2RGP31785 369 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MDS2Q8NDY4 140 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 MIOXQ9UGB7 285 aa7.28□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.28□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IFNA5P01569 189 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HBZP02008 142 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CD46P15529 392 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 AGAP20933 346 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UCP2P55851 309 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 FAM122AQ96E09 287 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SPIN2AQ99865 258 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SMCO3A2RU48 225 aa7.27□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 J3QT63 122 aa7.27□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 M0R296 226 aa7.27□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
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