RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	YKT6	O15498	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MT-CO3	P00414	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	KITLG	P21583	273 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	STARD6	P59095	220 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1L1	Q8NH94	360 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	USP34	Q70CQ2	3546 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SPRY3	O43610	288 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PITX3	O75364	302 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	HTD2	P86397	168 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	OR8B8	Q15620	311 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	WNT9B	O14905	357 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CD5	P06127	495 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MPZ	P25189	248 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	DCAF10	Q5QP82	559 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2H2	O95918	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GALR1	P47211	349 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	XKRY2	A2RUG3	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB31	Q13636	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FGFRL1	Q8N441	504 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LILRA1	O75019	489 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CD55	P08174	381 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	BAGE3	Q86Y29	109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	BAGE2	Q86Y30	109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF3C1	Q12789	2109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		K7ESF4	209 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GNG10	P50151	68 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SOX8	P57073	446 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXO1	Q12778	655 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RTP5	Q14D33	572 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RBKS	Q9H477	322 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	VSIR	Q9H7M9	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFB7	P17568	137 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CREBBP	Q92793	2442 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL2	P10415	239 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FOSL1	P15407	271 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CRYGS	P22914	178 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF83	P51522	516 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		J3QT63	122 aa		10.04	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms