RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF9BQ9HBM6 251 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNIP1Q9NZI2 227 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MZ25 164 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TPPP2P59282 170 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NPBQ8NG41 125 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL15Q9H469 300 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 AMBNQ9NP70 447 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX16Q9Y5Y5 336 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA3O95167 84 aa21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 CX3CL1P78423 397 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR176Q14439 515 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 HAGHQ16775 308 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf54Q5BKX5 351 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PYHIN1Q6K0P9 492 aa21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV1-51P01701 117 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CD40LGP29965 261 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPK1Q13546 671 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBA4BQ9H853 241 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 JPT1Q9UK76 154 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF150Q9ULK6 438 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTBL2Q562R1 376 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF3L1Q8IXM7 274 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED9Q9BVK6 235 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2QL1A1L167 161 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MUL1Q969V5 352 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 EI24O14681 340 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RRHO14718 337 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS11O94810 467 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MAS1P04201 325 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB40BQ12829 278 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 XAF1Q6GPH4 301 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.96■□□□□ 0.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FCN1O00602 326 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV3P03979 118 aa20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-217ENST00000629983 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GTSCR1Q86UQ5 136 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GAPTQ8N292 157 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SELENOIQ9C0D9 397 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CKLFQ9UBR5 152 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GAB2Q9UQC2 676 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y980 276 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 YPEL1O60688 119 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZP3P21754 424 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 AWAT2Q6E213 333 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LFNGQ8NES3 379 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RDH12Q96NR8 316 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 YPEL2Q96QA6 119 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RETNQ9HD89 108 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C2Y5 167 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRB1P18505 474 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT3P21217 361 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC58Q4VC31 144 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GALMQ96C23 342 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 HTD2P86397 168 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CYYR1Q96J86 154 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM110AQ9BQ89 295 aa20.92■□□□□ 0.94
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