RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627809.1

SPTAN1-213, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 3

Gene SPTAN1, Length 342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-213ENST00000627809 SCGB2A2Q13296 93 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IL18Q14116 193 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 KIR2DS1Q14954 304 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 Q3ZCU0 254 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CNIH2Q6PI25 160 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 Q6ZS49 121 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 PRR18Q8N4B5 295 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 C3orf56Q8N813 242 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 KIRREL1Q96J84 757 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 A0A087X0M5 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 A0A1B0GX30 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 A0A1W2PPE3 182 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 FABP12A6NFH5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 TOR1AO14656 332 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CTDSPLO15194 276 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SSX5O60225 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 YPEL1O60688 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 RGS11O94810 467 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 DIRAS3O95661 229 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CTXN2P0C2S0 81 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 PTHLHP12272 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CD34P28906 385 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LGALS4P56470 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LOXL3P58215 753 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LTC4SQ16873 150 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 STEAP3Q658P3 488 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR1L1Q8NH94 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF596Q8TC21 504 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GPX8Q8TED1 209 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 YPEL2Q96QA6 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF747Q9BV97 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IFT46Q9NQC8 304 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 JPT1Q9UK76 154 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 J3QR06 171 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 FABP7O15540 132 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 HSPA12AO43301 675 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 RBBP9O75884 186 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ARG1P05089 322 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LPLP06858 475 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SCTP09683 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GSTT2P0CG29 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GSTT2BP0CG30 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 NAT1P18440 290 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZBTB25P24278 435 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 MORN2Q502X0 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 MIDNQ504T8 468 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF626Q68DY1 528 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CCDC190Q86UF4 302 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 HOGA1Q86XE5 327 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 BEST4Q8NFU0 473 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 OR9G1Q8NH87 305 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ABHD1Q96SE0 405 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SSX3Q99909 188 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CITED1Q99966 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 SOSTQ9BQB4 213 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ZNF702PQ9H963 129 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 GNG12Q9UBI6 72 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-213ENST00000627809 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.1 ms