RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	APOPT1	Q96IL0	206 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CMTM3	Q96MX0	182 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PHB2	Q99623	299 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BQF6	201 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		J3KTA2	159 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TPST1	O60507	370 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	INMT	O95050	263 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT75	O95678	551 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	HBE1	P02100	147 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	APELA	P0DMC3	54 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	M6PR	P20645	277 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SSTR5	P35346	364 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CACNG7	P62955	275 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IL24	Q13007	206 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G7	Q13093	441 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TXN2	Q99757	166 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf58	C9J3I9	102 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LECT2	O14960	151 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC31A2	O15432	143 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2J3	O76001	311 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CSN2	P05814	226 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SBK3	P0C264	359 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CFC1	P0CG37	223 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD11B1	P28845	292 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX30	Q5JUR7	227 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TSSK2	Q96PF2	358 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF2	Q99496	336 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PKIB	Q9C010	78 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF878	C9JN71	531 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	DCTN6	O00399	190 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ISLR	O14498	428 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MPPED1	O15442	326 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNK	O75909	580 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2H2	O95918	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYGD	P07320	174 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RPA2	P15927	270 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB9	P50453	376 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	HTD2	P86397	168 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPE	Q05469	1076 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP8	Q14790	479 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.9	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms