RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	STUM	Q69YW2	141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PELI1	Q96FA3	418 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR4C12	Q96R67	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LITAF	Q99732	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GHITM	Q9H3K2	345 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OPA3	Q9H6K4	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		R4GMQ9	66 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		V9GYS6	101 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0G2JLM5	398 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		F8VVB4	439 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768		F8VWA3	439 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CDIPT	O14735	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	AKR7A2	O43488	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF254	O75437	659 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DHRS3	O75911	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LALBA	P00709	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	IFNA4	P05014	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T7	P0C7T2	308 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DDOST	P39656	456 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	DYNLT3	P51808	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CDC42	P60953	191 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GMFB	P60983	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZSCAN26	Q16670	478 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TEX38	Q6PEX7	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CALHM1	Q8IU99	346 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T27	Q8NH04	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	AQP3	Q92482	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PIGC	Q92535	297 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MALSU1	Q96EH3	234 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GAFA1	Q96PS6	74 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MLH1-223	ENST00000616768	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms