RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYG1Q8N1E2 194 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF596Q8TC21 504 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C17orf50Q8WW18 174 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 S100ZQ8WXG8 99 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF150Q9ULK6 438 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ODF3BA8MYP8 253 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YPEL1O60688 119 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FSHBP01225 129 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSF1P09603 554 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR5H8P0DN80 308 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRD5A1P18405 259 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAT1P18440 290 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD34P28906 385 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FCGR2CP31995 323 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 REG1BP48304 166 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPAN5P62079 268 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF846Q147U1 533 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAK1Q16611 211 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF626Q68DY1 528 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEX29Q8N6K0 151 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM63Q969Q1 353 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YPEL2Q96QA6 119 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC6A7Q99884 636 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR2D2Q9H210 308 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMP28Q9H239 520 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A087X0M5 115 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1B0GX30 115 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB3DO95716 219 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMY2AP04746 511 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IFNA6P05013 189 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTXN2P0C2S0 81 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR8U9P0C7N5 309 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AADACP22760 399 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTR1DP28221 377 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF134P52741 427 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP5CP53041 499 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HERV-K104P61576 105 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACTBL2Q562R1 376 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM17Q86X19 198 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR8U1Q8NH10 309 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR56B4Q8NH76 319 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOMM40LQ969M1 308 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCUBQ9NWR8 336 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIRAS3O95661 229 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKAIN1P0CW23 69 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL7P13232 177 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL3RAP26951 378 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD40LGP29965 261 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR12P47775 334 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSX2Q16385 188 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q3ZCU0 254 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSC22D3Q99576 134 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM160Q9NX00 188 aa11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa11.79□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.79□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSD17B6O14756 317 aa11.79□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPYP01298 95 aa11.79□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGLV1-47P01700 117 aa11.79□□□□□ -0.52
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms