RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603844.1

FOCAD-210, Transcript of focadhesin, humanhuman

TSL 3

Gene FOCAD, Length 693 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCAD-210ENST00000603844 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 HOGA1Q86XE5 327 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CD177Q8N6Q3 437 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 BEST4Q8NFU0 473 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR4S1Q8NGB4 309 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR4K15Q8NH41 348 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SNAPC3Q92966 411 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CCL19Q99731 98 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MMP28Q9H239 520 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.13□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PTPN13Q12923 2485 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 USF3Q68DE3 2245 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PPIAL4DF5H284 164 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TMEM178BH3BS89 294 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 LHBP01229 141 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CD8AP01732 235 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GYPAP02724 150 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CD74P04233 296 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 DANCRP0C864 163 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 LYNX1P0DP58 116 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GIFP27352 417 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SLC6A1P30531 599 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 BTCP35070 178 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GLP1RP43220 463 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KIR2DS4P43632 304 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR3A1P47881 315 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KCNJ3P48549 501 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CCR6P51684 374 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 HLA-DRB3P79483 266 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KIR2DS1Q14954 304 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CDK10Q15131 360 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KCNJ8Q15842 424 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SHEQ5VZ18 495 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 STUMQ69YW2 141 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ACSM6Q6P461 480 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PLET1Q6UQ28 207 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TMEM17Q86X19 198 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 OR56B4Q8NH76 319 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CCDC107Q8WV48 283 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GLMPQ8WWB7 406 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 DEDD2Q8WXF8 326 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TIMD4Q96H15 378 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GAFA1Q96PS6 74 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 CCL13Q99616 98 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PRRT1Q99946 306 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 GINS4Q9BRT9 223 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 NUDT15Q9NV35 164 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 EHFQ9NZC4 300 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 COPZ2Q9P299 210 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 KIF25Q9UIL4 384 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 ZNF222Q9UK12 451 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 SPG11Q96JI7 2443 aa4.12□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 A0A1B0GVG6 124 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 A0A1B0GW55 424 aa4.11□□□□□ -1.75
FOCAD-210ENST00000603844 FUOMA2VDF0 154 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms