RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 BVESQ8NE79 360 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 NARFLQ9H6Q4 476 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PFDN1O60925 122 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8U9P0C7N5 309 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-43DP0DP04 118 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OMGP23515 440 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DNASE1P24855 282 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX6P56179 175 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8U1Q8NH10 309 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SSNA1O43805 119 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPFP07098 398 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4GP0DN37 164 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL3L1P16619 93 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 VAMP1P23763 118 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB7AP51149 207 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LTC4SQ16873 150 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF645Q8N7E2 425 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AK2Q8NG84 335 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52B4Q8NGK2 314 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL28Q9NRJ3 127 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPE2 198 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PR64 198 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRV1 198 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf98A8MV24 154 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MXK9 166 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SFT2D2O95562 160 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP10-9P60411 292 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRAD3Q86YD5 345 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDND2Q8NHS1 167 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT14Q96FL9 552 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA3P12429 323 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD9Q7L273 389 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MITD1Q8WV92 249 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PHB2Q99623 299 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA60Q9H7X0 242 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN13Q12923 2485 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC105371242A0A075B767 164 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0B4J2A0 478 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 LMO4P61968 165 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLDA2Q53GA4 152 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 AGMATQ9BSE5 352 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SHPKQ9UHJ6 478 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B6O14756 317 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GALNT1O75752 331 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NFYBP25208 207 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD6Q96DN6 1003 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2D2Q9H210 308 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 GAB2Q9UQC2 676 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087X0M5 115 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GX30 115 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MPPED1O15442 326 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA2P01563 188 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB113Q30KQ7 82 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf31Q8N9H6 132 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SUCNR1Q9BXA5 334 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNS2Q9ULS6 477 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf46C9J442 243 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP23AO75900 390 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A16P16260 332 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP14Q86UN6 197 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF439Q8NDP4 499 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ8AQ8NI60 647 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-14P01704 120 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1A3P0DMM9 295 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1A4P0DMN0 295 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-8P0DP01 117 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CD34P28906 385 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf42Q8N5U0 333 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 DRAM1Q8N682 238 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NEURL2Q9BR09 285 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG11Q9UQ72 335 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SESN1Q9Y6P5 492 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R1W7 72 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ENSAO43768 121 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXH1O75593 365 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D26Q86UD7 250 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R14BQ96C90 147 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF212BA8MTL3 300 aa25.46■■□□□ 1.67
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