RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDS2O95674 445 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM50AO95807 157 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1-39P01597 117 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1D-39P04432 117 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PET100P0DJ07 73 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 EPHA1P21709 976 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 COL10A1Q03692 680 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TBR1Q16650 682 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RFESDQ8TAC1 157 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf30Q96GV9 206 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM56Q96MV1 263 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TACC2O95359 2948 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPRY3O43610 288 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSTR5P35346 364 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIMP3P35625 211 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1C3P42330 323 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RND3P61587 244 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMCO1Q147U7 214 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZRM9 215 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 USF3Q68DE3 2245 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MXE2 369 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CTXN2P0C2S0 81 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 F2RP25116 425 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 UCP1P25874 307 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NMSQ5H8A3 153 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARL11Q969Q4 196 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHOFQ9HBH0 211 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DSCAMO60469 2012 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSSCA1O60232 199 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNAPINO95295 136 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-13P01766 116 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-7P01780 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 HEXAP06865 529 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF224P0DH78 156 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OMGP23515 440 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GABRA2P47869 451 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 EDDM3AQ14507 147 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 HMGN3Q15651 99 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 LTC4SQ16873 150 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 UTF1Q5T230 341 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2V2Q96R30 315 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NBASA2RRP1 2371 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST8SIA3O43173 380 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD80P33681 288 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZRG5 221 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLS2Q9UI32 602 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGSF23A1L1A6 192 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 E5RGE8 158 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 HBZP02008 142 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRYAAP02489 173 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 LMO1P25800 156 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF585BQ52M93 769 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DRAM1Q8N682 238 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR146Q96CH1 333 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MUCL1Q96DR8 90 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MMP26Q9NRE1 261 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NSG2Q9Y328 171 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms