RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 SP6Q3SY56 376 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ZNF525Q8N782 197 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 NRGNQ92686 78 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 CHIAQ9BZP6 476 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 JPT1Q9UK76 154 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 MMP23AO75900 390 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ANXA3P12429 323 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 H2BFSP57053 126 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ERVFRD-1P60508 538 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 LEAP2Q969E1 77 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 RNF150Q9ULK6 438 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ST8SIA5O15466 376 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 SLC22A5O76082 557 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 IFNA2P01563 188 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 OR5AC1P0C628 307 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TMEM33P57088 247 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ZFP69Q49AA0 526 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 C11orf88Q6PI97 169 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 C5orf30Q96GV9 206 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 OR2D2Q9H210 308 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 MORN2Q502X0 79 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 BVESQ8NE79 360 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 OR8B2Q96RD0 313 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 DBX1A6NMT0 343 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 MPPED1O15442 326 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 NFYBP25208 207 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 RND3P61587 244 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 ZNF714Q96N38 554 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 TP53RKQ96S44 253 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 MIOXQ9UGB7 285 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 PSG11Q9UQ72 335 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 CENPEQ02224 2701 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 WNT2P09544 360 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 DRAM1Q8N682 238 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 GALNT14Q96FL9 552 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 VPS13CQ709C8 3753 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 SLC31A2O15432 143 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 YPEL1O60688 119 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 TMEM187Q14656 261 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 COQ8AQ8NI60 647 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 YPEL2Q96QA6 119 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 ADAP1O75689 374 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 ZNF134P52741 427 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 RAB9BQ9NP90 201 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 A0A0B4J2A0 478 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 A0A1W2PPE3 182 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 OR51H1Q8NH63 302 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 AGMATQ9BSE5 352 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 FAM25EA8MYX2 175 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 OR2A4O95047 310 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 CRYZL1O95825 349 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 GNG10P50151 68 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 DLX6P56179 175 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC2-208ENST00000566635 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.4 ms