RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	BPIFB3	P59826	476 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	GABARAPL2	P60520	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52W1	Q6IF63	320 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C16orf87	Q6PH81	154 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF773	Q6PK81	442 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ASCL4	Q6XD76	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	DYRK2	Q92630	601 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	LEAP2	Q969E1	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CST11	Q9H112	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288		V9GY05	133 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WXM4	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BUX3	64 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	AIP	O00170	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP23A	O75900	390 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	MELTF	P08582	738 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	UCHL1	P09936	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	UBB	P0CG47	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CD36	P16671	472 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB3B	P20337	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	GZMH	P20718	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	GADD45A	P24522	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CD24	P25063	80 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	IER3	P46695	156 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10A3	P58181	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	HILS1	P60008	231 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	IL13RA2	Q14627	380 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	SSX1	Q16384	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZTK2	550 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH26	Q8IXH8	852 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM104	Q8NE00	496 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF21A	Q96BD5	680 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	COQ2	Q96H96	371 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-238	ENST00000556288	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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