RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	OR52D1	Q9H346	318 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617		V9GYS6	101 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	SPAG7	O75391	227 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TUSC2	O75896	110 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	T-ENOL	P0DO92	83 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	LGALS7	P47929	136 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ARL11	Q969Q4	196 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GTI1	187 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM223B	A6NKX1	122 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BNX3	289 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TTR	P02766	147 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ABHD2	P08910	425 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	IDO1	P14902	403 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ARL3	P36405	182 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	GZMM	P51124	257 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	VSNL1	P62760	191 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	C15orf32	Q32M92	178 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4A47	Q6IF82	309 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB21	Q9UL25	225 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	EVPLL	A8MZ36	301 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	PRR32	B1ATL7	298 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2J3	O76001	311 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	BPGM	P07738	259 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	SPI1	P17947	270 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	CNPY4	Q8N129	248 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617	BAG5	Q9UL15	447 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ABCD4-222	ENST00000555617		H0YJX3	145 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	DEGS1	O15121	323 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC22A1	O15245	554 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	IDH3B	O43837	385 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	KRT36	O76013	467 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	C1QB	P02746	253 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GNMT	Q14749	295 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617		Q96M66	194 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	OR9G9	P0C7N8	305 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CRMP1	Q14194	572 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RFT1	Q96AA3	541 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	APOPT1	Q96IL0	206 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	INTS14	Q96SY0	518 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ETV7	Q9Y603	341 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617		H0YJW9	148 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CYB5A	P00167	134 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	REG1A	P05451	166 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RPA2	P15927	270 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP2K4	P45985	399 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB131A	P59861	70 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PAX5	Q02548	391 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617		Q3ZCU0	254 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10A6	Q8NH74	314 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC107	Q8WV48	283 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TPD52L3	Q96J77	140 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PPCS	Q9HAB8	311 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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