RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 UBE2WQ96B02 151 aa2.89□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ACY3Q96HD9 319 aa2.89□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.89□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.88□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ACOX3O15254 700 aa2.88□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-53P01767 116 aa2.88□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.88□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 OR11G2Q8NGC1 345 aa2.88□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 POLR1DQ9Y2S0 133 aa2.88□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 A0A0B4J2C4 111 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 TGOLN2O43493 480 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 CTLA4P16410 223 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 MYL12AP19105 171 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ORM2P19652 201 aa2.87□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 GABRA3P34903 492 aa2.87□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 PPP1R1AQ13522 171 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 MAPK14Q16539 360 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ACSBG2Q5FVE4 666 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 PRR9Q5T870 116 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 OPTNQ96CV9 577 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 MED28Q9H204 178 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 M0R036 132 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 IGLV3-27P01718 113 aa2.86□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 FOXA1P55317 472 aa2.86□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.86□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 A6NED7 52 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 D6RAR5 112 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 C15orf65H3BRN8 121 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 K7EQS6 105 aa2.85□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 SH2D1AO60880 128 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 DCTN3O75935 186 aa2.85□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 CRABP2P29373 138 aa2.85□□□□□ -1.95
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USP15-218ENST00000552346 OR1E2P47887 323 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 SLC35A2P78381 396 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 FABP5Q01469 135 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 DHRS2Q13268 280 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 PDGFRLQ15198 375 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 LRP11Q86VZ4 500 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 CD200R1Q8TD46 325 aa2.85□□□□□ -1.95
USP15-218ENST00000552346 Q8WTZ3 238 aa2.85□□□□□ -1.95
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