RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222		A0A075B6Q4	140 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	XRCC3	O43542	346 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HPGDS	O60760	199 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CD3G	P09693	182 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	RAB13	P51153	203 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222		A0A087X0M5	115 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GX30	115 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	F2RL2	O00254	374 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SPINT2	O43291	252 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HBZ	P02008	142 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ELK1	P19419	428 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CD34	P28906	385 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222		Q9N2K0	584 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CTDSP2	O14595	271 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	FCGR3A	P08637	254 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	DTYMK	P23919	212 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	COX7A1	P24310	79 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	PITPNA	Q00169	270 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	LSAMP	Q13449	338 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HMGN3	Q15651	99 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	UTF1	Q5T230	341 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	LCE6A	A0A183	80 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SSX5	O60225	188 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	NFYB	P25208	207 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TALDO1	P37837	337 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TAS2R20	P59543	309 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LTC4S	Q16873	150 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GALM	Q96C23	342 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65

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