RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 BMPERQ8N8U9 685 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MZB1Q8WU39 189 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 OR4C12Q96R67 309 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ST20Q9HBF5 79 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 GPANK1O95872 356 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF11O14788 317 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BKO60814 126 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BOP23527 126 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BBP33778 126 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BDP58876 126 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A6NIN4 97 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF787Q6DD87 383 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PP11 408 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 GZMBP10144 247 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TEX38Q6PEX7 206 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FOXB1Q99853 325 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NSG2Q9Y328 171 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 V9GY05 133 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 M0QXV9 152 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ORM1P02763 201 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TACR1P25103 407 aa5.5□□□□□ -1.53
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