RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 DPM3Q9P2X0 92 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 PSG11Q9UQ72 335 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 A0A087WXM4 84 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 A0A087X0M5 115 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GX30 115 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 IFITM5A6NNB3 132 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LEUTXA8MZ59 168 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 C12orf77C9JDV5 145 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 H3BUI4 141 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 J3QR06 171 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 ORC5O43913 435 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 IGLV1-47P01700 117 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 GLAP06280 429 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CD24P25063 80 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CD34P28906 385 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 EFNB2P52799 333 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TMEM50BP56557 158 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MXD1Q05195 221 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MLANAQ16655 118 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR9G1Q8NH87 305 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR1L1Q8NH94 360 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MRAPQ8TCY5 172 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 RAB22AQ9UL26 194 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LDLRAD4O15165 306 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 SPINT2O43291 252 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CA11O75493 328 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 HBZP02008 142 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LPLP06858 475 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 SDC2P34741 201 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 C6orf183Q5T699 404 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 Q6ZSV7 163 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 Q6ZTK2 550 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TMEM219Q86XT9 240 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 Q8N1Y9 231 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 GAPTQ8N292 157 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 SETD6Q8TBK2 473 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 KCTD7Q96MP8 289 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CENPOQ9BU64 300 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MMP28Q9H239 520 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 AK3Q9UIJ7 227 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 COL7A1Q02388 2944 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 NOTOA8MTQ0 251 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 VGLL3A8MV65 326 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LY6LH3BQJ8 138 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 F2RL2O00254 374 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CHST1O43916 411 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TGFBR1P36897 503 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 CEACAM3P40198 252 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 RANBP1P43487 201 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LOXL3P58215 753 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 AANATQ16613 207 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TPRA1Q86W33 373 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 LINC01006Q8NI28 216 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 PECRQ9BY49 303 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 GNG12Q9UBI6 72 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 TCF19Q9Y242 345 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-217ENST00000550044 A0A075B6Q4 140 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 A6NDX4 124 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 SLC31A2O15432 143 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 NDUFA7O95182 113 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 BRS3P32247 399 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 ZNF134P52741 427 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-217ENST00000550044 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms