RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 CST9LP1Q5W188 147 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LINC01551Q86U37 167 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TDHQ8IZJ6 230 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DIRC2Q96SL1 478 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 WNT5BQ9H1J7 359 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 A6NNC1 897 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C11orf94C9JXX5 98 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGHV4-34P06331 123 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KITLGP21583 273 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LTBRP36941 435 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 GNG10P50151 68 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 BRICD5Q6PL45 260 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MKXQ8IYA7 352 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF611Q8N823 705 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FADS6Q8N9I5 356 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR1L3Q8NH93 324 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CLDN23Q96B33 292 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ARID1AO14497 2285 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 GJE1A6NN92 205 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 A8MXE2 369 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 K7EP13 123 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TCF21O43680 179 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 NXPH3O95157 252 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGLV3-19P01714 112 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MT-ND6P03923 174 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 REG1AP05451 166 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SCTP09683 121 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IAPPP10997 89 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TDGF1P13385 188 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 GCH1P30793 250 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CDKN1BP46527 198 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RTP5Q14D33 572 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RAB1CQ92928 201 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SFRP2Q96HF1 295 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF576Q9H609 170 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PN81 502 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PAGE4O60829 102 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CYC1P08574 325 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PSG2P11465 335 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CHRNA7P36544 502 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PTGDSP41222 190 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ARL16Q0P5N6 197 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 BATFQ16520 125 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZPA2 131 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZWC4 215 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 BAGE3Q86Y29 109 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 BAGE2Q86Y30 109 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PIGCQ92535 297 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A22Q9H936 323 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 EDN3P14138 238 aa9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ADMP35318 185 aa9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PTTG1IPP53801 180 aa9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CCL7P80098 99 aa9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms